个性化印刷在实施过程中面临众多挑战，：这既有纯技术问题，也有市场和管理问题，包括对标准的需要、数据处理和性、印张的准确性问题、装订及后处理要求、市场接受程度及需求。第二：从目前的发展情况看，它还没有成为一个真正成熟的产业。关键问题要有更多的业内人士和印刷企业投入其问，为个性化印刷添加动力，将潜在的市场变为现实的行业，同时也为个性化印刷开辟新的赢利点。据IBM进行的调查表明，71%的客户计划在未来的两三年内采用个性化印刷，其中43%将采用彩色个性化印刷技术。
在国内，个性化印刷发展主要存在两个方面的障碍：一是个性化印刷市场尚未形成，规模和需求太少，还未引起人们足够的重视；二是从事个性化印刷的成本太高，同时还要考虑到企业的承受能力，选择适合企业实际情况的设备；另一方面，由于传统印刷观念的影响，大多数人都形成了一种根深蒂固的想法：印刷只能做大批量业务。